پروبیوتیکها ایمن هستند و اغلب به عنوان عوامل GRAS توسط سازمان غذا و داروی آمریکا (FDA)ثبت شدهاند همچنین ایمنی آنها نیز مورد تایید اروپا و ژاپن قرار گرفته است.